Le département d'Ingénierie de Prophase Telecom, est le centre de l'entreprise, situé au même niveau que la direction de la compagnie. C'est un département stratégique. Tous les procès techniques doivent être validés par ce département. Il est constitué par des ingénieurs de télécommunications et des techniciens électroniques, qui ont expérience digne de confiance en systèmes électroniques, réseaux de télécommunications avec et sans fils, systèmes de fibre optique et liaisons point à point.
C'est le département d'Ingiénerie qui a permis à Prophase Telecom passer d'être une micro entreprise à une entreprise moyenne avec vocation de réaliser des projets célèbres de télécommunications. Prophase Telecom est devenue une entreprise capable d'implémenter des réseaux de telécoms réservés aux grandes multinationales et de donner service à des compagnies et aux Administrations Publiques qui s'étaient résigné aux grands opérateurs. C'est ce département qui permettra la croissance de l'entreprise avec un profil technique, d'innovation et déroulement sur le profil commercial et c'est celui qui permet et permettra de changer d'un modèle productif basé sur le travail à un autre basé sur l'innovation.